Jeżeli wszelkie poprzednie gry komputerowe tego rodzaju (wliczając w to pozostałe tytuły z serii Silent Hunter) zostały symulatorami okrętów podwodnych, to o grze Battle of the Atlantic tego samego powiedzieć się już nie da. Programiści z Ubisoft Romania zafundowali nam bowiem 1-wszy w historii symulator kapitana okrętu podwodnego. Różnica na pozór niewielka, ale de fakto stawia ona cała rozgrywkę na głowie, co wychodzi grze na dobre. Cała gra została podporządkowana tej idei. Wnętrze okrętu jest w pełni trójwymiarowe i umożliwia na to, o czym fani marzyli od lat: na swobodne przechadzanie się po całym pokładzie. Nie jest to jedynie efekt wizualny, tutaj niemalże wszystko opracowujemy z punktu widzenia kapitana. By wydać rozkaz, musimy znaleźć adekwatnego członka załogi i ustnie poinformować go o naszych oczekiwaniach. Analogicznie z obsługą przyrządów, do każdego należy podejść i kliknąć na odpowiednie urządzenie. Także w trybie peryskopu komenderujemy, rozmawiając z oficerem.